目標資訊素的環化進行的非常順利,不過徐雲並沒有因此而產生絲毫鬆懈。
這間生物醫藥實驗室的使用時間是十四天,雖然明面上來說,課題組只要在這個時間內解決四代吡蟲啉的合成就能算成功。
但先前提及過,徐雲的終極目標遠遠不是一個四代這麼簡單。
這次實驗由於需要用到大量裝置的緣故,整個專案從立項開始便借用了田良偉輔項專案的名義。
一旦時限完結,屆時哪怕是田良偉也很難再給徐雲提供這麼好的實驗條件。
因此這可以說是徐雲當前最好的機會,一旦將它錯過,輕則拖後第五代吡蟲啉的研發,重則可能影響到知識點和時空副本的開啟。
所以在對目標資訊素完成環化後,徐雲等人絲毫沒有懈怠,一邊繼續進行了12小時的攪拌反應。
並於次日凌晨在冰浴冷卻下,用飽和NH4Cl水溶液進行了淬滅反應。
到了這一步,剩下的便是將資訊素結合蛋白於吡蟲啉進行合成的環節了,也是幾位生物研究生的主方向。
這個環節通俗點來說就是無限次的碰運氣,環化後的資訊素結合蛋白好比是一個鐵環,為了好理解就假設將它按時鐘刻度分成十二格吧。
徐雲等人要做的就是拿個小鋼珠從上往下丟,由於他們對9到12點鐘方向做過了環化處理,所以鋼珠的落點必然是9-12之間。
但這個刻度遠遠不夠精細,鋼珠只有穩穩的落到46分這個數字上,徐雲等人的合成才能算成功——請注意,這只是宏觀角度上一個比較好理解的說法,實際上那個圓盤的刻度數字要比12大上無數倍,比如是......
“22440484對!”
實驗室內,周佩瑤看著IlluminaHiSeq高通量二代測序平臺測序出的數字,平穩的對徐雲說道:
“學長,我們透過小分子熒光競爭性結合實驗研究了兩個OBP與目標資訊素的結合能力,一共獲得的鹼基資料量約為6.6G,過濾掉原始資料後的讀數為22440484。
目標資訊素與美洲大蠊樣本的基因組比對一致性為84.62%左右,德國小蠊則為83.68%,結合部讀數的理論值為648!”
22440484比648,三萬五千分之一的機率,這絕不是一件簡單的事兒。
聽到這個數字,徐雲輕輕點了點頭,轉而看向裘生:
“老裘,看咱倆的了。”
裘生一拍他肩膀,笑道:
“沒啥說的,肝唄,大不了把哥們的這一頭秀髮都犧牲在這兒嘛。”
說著他表情一肅,拿起一條類似超市小票的紙條看了幾眼:
“19.10和19.36kDa,蛋白質電泳條帶的位置與預測的分子量一致,小任,直接上熒光競爭結合試驗吧。
爭取三個小時內把3,11-二甲基正二十七烷-2-酮和目標資訊素的結合能力測出來,這樣咱們會輕鬆很多。”
一旁任永存扶了扶眼鏡,熟練的將早就準備好的兩個試劑結合到了一起。
徐雲則站到了在保持通風的超淨臺內,加入定量好的目標資訊素1μg、AnchoredOligo4μg、2×ESReactionMix10μl、gDNARemover1μl,最後加入RNase-freeWater至混合液體積為20μl。
隨後他將20μl混合液輕彈試管混勻,遞給周佩瑤:
“小周,設定42℃,在PCR儀器中孵化15分鐘,然後85°加熱5秒。
再把合成的cDNA模板定量,1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測合格後儲存到零下二十度的環境裡。”
周佩瑤接過試管,重重點頭:
“您放心吧,學長!”
如果說昨天的環化實驗是一篇克蘇魯狗糧文的話,那麼今天的合成實驗則無疑是個治癒的小故事。
沉睡中,它被喚醒了。
身邊的同行催促著它:
“喂喂,該起來了,自從上個週期開始,你就一直沒動過呢。”
哦,它想起來了,它是是一個線解聚合酶,還沒有遇到它的sigma因子。
雖然前幾天才剛過聖誕,但對它來說那不過是一個尋常的夜晚。
他就跟著同伴走啊走,不知過了多久,它的耳邊傳來一聲溫柔的呼喚。
“你...好嗎?”
它扭過頭,看到一個美麗的倩影,亭亭玉立,笑顏如花。
它一時竟然不知道如何回答,只能乾巴巴道:
“你...你好呀。”
她太美了,它不敢祈求什麼,或許她只是來問最近的啟動子在哪兒,那裡的聚合酶比它的合成能力可強得多了。
“那個...我是一個Oligo引物,不小心迷路了,能麻煩你給我指個路嗎?”
它看著她的眼睛,不假思索地說:
“好呀。”
它紳士地連線起她的結合域,她羞澀地默許了,它們就這樣在核基質裡散著步,和她一起數著染色體上美麗的條帶。
就這樣,不知過了多少個週期。
某天,她突然驚喜地搖著它的β鉗子:
“你看那兒!”
它朝著她手指的方向望去,那是一條序列:
AUGAUACUCUAGGUGGAGUAUUGAUGA
那不是.....
愛的密碼嗎?
她一路飛奔過去,輕輕靠在-35序列上,一臉迷醉。
看著這一幕,忽然,它鼓起了勇氣:
“那個......你能做我的女朋友嗎?”
她的表情忽然愣住了,臉上揚起一絲苦澀:
“我只是一個引物,可能明天就會消亡了,我們的結合是被詛咒的.....”
“一定不會的!我們一定會一直幸福下去!”
它一把抱住她,用力撐開兩條緊緊結合的互補鏈。
她沒做太多反抗,於是乎,它們開始了愛情之旅。
一切都很順利,它看著身後不斷延伸的信使鏈,回頭望一望眼中最可愛的她,心中湧動起要保護她一生的衝動。
能得到這樣可愛的一位姑娘相伴一生,真是三生有幸!
就這樣,又是一段時間過去。
然而某一天,意外出現了。
這個世界的溫度忽然開始降低,大量的物質開始凋零、凍結甚至死亡。
它用盡全身力氣緊緊的環繞著她,但隨著一陣顛簸,它和她結合在一起的結構域突然鬆動了!
它撕心裂肺地大喊:
“抓緊我,別放開!我會有辦法的!”
抖動中傳來她無助的回應,帶著絕望與哭泣:
“沒用的,我做不到!”
一陣環流過後,她離它越來越遠。
“把我們的信使鏈合成完,我永遠愛你!”
她小小的身影慢慢淡出它的視線,消失在冰冷的核纖層。
它絕望的仰天大喊,怒叱著命運的不公。
可是該走的路還得走下去,只是現在的它孤身一人了。
它費力地開啟粘合著的雙鏈,把一個個核苷酸安放好,每一個鹼基都代表了它對她深深的思念。
可是漸漸地,它也感受到了疲憊。
周圍的電子不斷攻擊著它的核心蛋白,它的亞基漸漸鬆動,最觸目驚心的是,它的身後,不知從什麼時候起延伸了一條短短的泛素鏈。
它明白,它的生命即將抵達終點。
彌留之際,它的腦海中閃動著她的笑靨。
原來我一直都這麼想念她啊,原來我一直深愛著她。
隨後它拖著自己的殘軀,就這樣緩緩的走啊走,最終來到了一處深坑外。
只見此時此刻,深坑中躺著無數與它相同的聚合酶,從雙鏈上不難看出,他們也都曾遇到過自己的那個她。
它有些費力的挪動到一個角落,目無焦距的看著天空:
“難道說,引物的結合註定沒有結果嗎?”
朦朧中,他的面前浮現出了她的三維結構,她彷彿正微笑著望著它,向它張開手臂......
就在它的意識即將消散的千分之一個剎那,他的余光中忽然出現了一大一小的兩道身影:
那是一個與他身形相似的同類,他的身邊並無伴侶,但它的氣質一條鏈上,此時赫然牽著一個精雕玉琢的小女孩。
“那是......那是.....”
他的呼吸驟然急促了起來。
其實不止是他,幾乎在一瞬間,由於tio引導效應的緣故,深坑中的每個‘它’都察覺到了來人的身影。
“親愛的,你看到了嗎?!”
它用盡全身最後的一絲力氣,就這樣笑了起來:
“原來......我們的愛情並沒有被詛咒......”
與此同時。
看著RPKM值熱土上極小極小的那塊紅點,徐雲不由長輸一口氣:
“第四代......終於突破了。”